検査と技術36巻12号

2008年11月発行

トピックス

ノンコーディングRNAの可能性

著者： 齋藤力¹ 林崎良英¹

所属機関： ¹理化学研究所横浜研究所オミックス基盤研究領域

ページ範囲：P.1383 - P.1385

■はじめに―Non-coding RNA worldの発見

　ヒトゲノムプロジェクトによるゲノムDNAの塩基配列の決定およびアノテーションによって，遺伝子の総数は22,287と推定された^1）が，ゲノムDNA中で蛋白質がコードされている領域はわずか2％以下であることが示された．一方で，マウスおよびヒトでの大規模cDNA(complementary DNA)解析がFANTOM(Functional Annomation of Mouse)1，2，3プロジェクトによって行われ，延べ151,047種類の転写産物の解析から，ゲノム全体の72％以上の領域からRNAが転写されていることが示され，転写産物のうち50％以上は蛋白質をコードしていないRNA(non-protein coding RNA，ncRNA)であることが示された^2）．さらに，Affymetrix社のGingerasのグループは，ゲノムタイリングアレイチップを用いたヒト21番，22番染色体の転写産物の網羅的解析から，同様に約60％の転写産物はncRNAであることを示した．

　このようにncRNAは転写産物のなかで大きな割合を占め，その機能が近年明らかになってきた．本稿では，ncRNAおよびその疾病とのかかわり，臨床検査や創薬に向けた取り組みの概略を述べる．詳細な解説は，栃谷らによる総説^3）や，特集「RNA研究の新知見と医療応用への展望」を参照していただきたい^4）．

参考文献

1) International Human Genome Sequencing Consortiumu:uFinishing the euchromatic sequence of the human genome. Nature　431：931-945，2004

2) Carninci P, Kasukawa T, Katayama S, et alu:uThe transcriptional landscape of the mammalian genome. Science　309：1559-1563，2005

3) 栃谷史郎，林崎良英：Non-coding RNA．生体の科学　57：229-236，2006

4) 林崎良英，安田純(編)：RNAの機能解明と医療応用．羊土社，2008

5) Kawahara Y, Zinshteyn B, Sethupathy P, et alu:uRedirection of silencing targets by adenosine-to-inosine editing of miRNAs. Science　315：1137-1140，2007

6) Lu J, Getz G, Miska EA, el alu:uMicroRNA expression profiles classify human cancers. Nature　435：834-838，2005

7) Volinia S, Calin GA, Liu CG, et alu:uA microRNA expression signature of human solid tumors defines cancer gene targets. Proc Natl Acad Sci USA　103：2257-2261，2006

8) 田口歩，高橋隆：ガンの発生と進展過程に関わるmiRNAの異常．林崎良英，安田純(編)：RNAの機能解明と医療応用．羊土社，pp163-168，2008

9) 秋山好光，湯浅保仁：miRNA発現プロファイル解析によるがんの診断への応用．林崎良英，安田純(編)：RNAの機能解明と医療応用．羊土社，pp173-178，2008

10) Lujambio A, Ropero S, Ballestar E, et alu:uGenetic unmasking of an epigenetically silenced microRNA in human cancer cells. Cancer Res　67：1424-1429，2007

11) 金玲，藤原将寿，中村義一：RNA医薬．林崎良英，安田純(編)：RNAの機能解明と医療応用．羊土社，pp193-198，2008