検査と技術43巻6号

2015年06月発行

技術講座 微生物

—step up編—パルスフィールドゲル電気泳動法と近年の分子疫学的手法

著者： 吉田敦¹

所属機関： ¹獨協医科大学感染制御センター，感染制御・臨床検査医学講座

ページ範囲：P.482 - P.486

Point

●パルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）法は，微生物のゲノムを制限酵素で切断した断片の多型を比較・解析するものである．

●株間の遺伝的同一性をみる方法として多くの微生物に応用され，最も普及したが，施設間で結果を比較することが容易でないなど，短所もあった．

●近年，その他の分子疫学的手法が進歩し，POT法やMLST法などが普及しつつある．各法の長所・短所・適応を考慮したうえで，利用していくことが望ましい．進展が著しい領域でもあるので，最新の情報を確認いただきたい．

参考文献

1）Schwartz DC, Cantor CR : Separation of yeast chromosome-sized DNAs by pulsed field gradient gel electrophoresis. Cell　37：67-75，1984

2）Herschleb J, Ananiev G, Schwartz DC : Pulsed-field gel electrophoresis. Nat Protoc　2：677-684，2007

3）バイオ・ラッド社：http://www.bio-rad.com/ja-jp/category/pulsed-field-gel-electrophoresis-systems

4）満田年宏：感染対策のための分子疫学入門─パルスフィールドゲル電気泳動法を中心に．メディカ出版，2002

5）松村康史：分子疫学解析に利用される遺伝子検査─臨床細菌編　Multilocus sequence typing（MLST）解析．臨病理　61：1116-1122，2013

6）MacCannell D : Bacterial strain typing. Clin Lab Med　33：629-650，2013