検査と技術46巻11号

2018年11月発行

技術講座 輸血・遺伝子検査 シリーズ　HLA-DNAタイピング検査・3

—step up編—新規検査法の可能性

著者： 中島文明¹

所属機関： ¹日本赤十字社中央血液研究所研究開発部

ページ範囲：P.1242 - P.1249

Point

●IMGT/HLAデータベース（http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/）には，全HLA遺伝子の塩基配列情報が登録され，さまざまな検索・閲覧ができる．

●ambiguityとは，HLA判定結果がA^＊02：15NとA^＊24：02，あるいはA^＊02：07とA^＊24：183Nのどちらかで，これ以上確定できない状態のことである．

●500ビーズのルミネックス法は，マイクロビーズ500種類との反応を1チューブで測定し，HLA-DNAタイピング検査の高精度化と高処理化を両立している．

●NGS法は，HLA遺伝子をクローンライブラリー化せずにDNA塩基配列を測定し，ambiguityがほとんどない結果が得られる．

参考文献

1）Terasaki PI, McClelland JD : Microdroplet assay of human serum cytotoxins. Nature　204：998-1000，1964

2）Saiki RK, Gelfand DH, Stoffel S, et al : Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Science　239：487-491，1988

3）Sanger F, Coulson AR : A rapid method for determining sequences in DNA by primed synthesis with DNA polymerase. J Mol Biol　94：441-448，1975

4）Immuno Polymorphism Database：IMGT/HLA（http://www.ebi.ac.uk/ipd/imgt/hla/）（2018年8月30日アクセス）

法の概要．臨検　58：536-540，2014

6）Gabriel C, Danzer M, Hackl C, et al : Rapid high-throughput human leukocyte antigen typing by massively parallel pyrosequencing for high-resolution allele identification. Hum Immunol　70：960-964，2009

7）Hosomichi K, Shiina T, Tajima A, et al : The impact of next-generation sequencing technologies on HLA research. J Hum Genet　60：665-673，2015

8）Hosomichi K, Jinam TA, Mitsunaga S, et al : Phase-defined complete sequencing of the HLA genes by next-generation sequencing. BMC Genomics　14：355，2013

9）菅野純夫，鈴木穣（監）：次世代シークエンサー—目的別アドバンストメソッド．学研メディカル秀潤社，2012

10）細道一善，井ノ上逸朗：HLA遺伝子の完全配列を決定する．二階堂愛（編）：次世代シークエンス解析スタンダード—NGSのポテンシャルを活かしきるWET＆DRY．羊土社，pp85-94，2014

11）Reinders J, Rozemuller EH, Otten HG, et al : Identification of HLA-A*0111N : a synonymous substitution, introducing an alternative splice site in exon 3, silenced the expression of an HLA-A allele. Hum Immunol　66：912-920，2005