公衆衛生84巻4号

2020年04月発行

特集 ゲノム革命—予防・医療のイノベーション

微生物ゲノム解析の進化—感染症の診断や疫学研究などへの応用

著者： 黒田誠¹

所属機関： ¹国立感染症研究所病原体ゲノム解析研究センター

ページ範囲：P.250 - P.255

【ポイント】
◆NGSによって起因病原体の正確な特定と，効果的な治療選択(薬剤感受性の推定)が可能である．
◆メタゲノム解読法によって原因不明疾患の起因病原体が同定できる．
◆病原体ゲノム情報を基盤にした欧米・アジア先進国との感染症対策ネットワークをつくり，データ・シェアリングを行っていく必要がある．

参考文献

1)厚生労働省：ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針．https://www.mhlw.go.jp/general/seido/kousei/i-kenkyu/genome/0504sisin.html

2)文部科学省，厚生労働省：人を対象とする医学系研究に関する倫理指針．https://www.mhlw.go.jp/file/06-Seisakujouhou-12600000-Seisakutoukatsukan/0000168764.pdf

3)Takeuchi F, et al:MePIC, metagenomic pathogen identification for clinical specimens. Jpn J Infect Dis 67:62-65, 2014

4)Hattori N, et al:Candidatus Mycoplasma haemohominis in Human, Japan. Emerg Infect Dis 26:11-19, 2020

5)Steer JA, et al:A novel hemotropic Mycoplasma(hemoplasma)in a patient with hemolytic anemia and pyrexia. Clin Infect Dis 53:e147-51, 2011

6)公益財団法人結核予防会結核研究所疫学情報センター：結核の統計　年報．https://www.jata.or.jp/rit/ekigaku/toukei/nenpou/

7)Sekizuka T, Kuroda M, et al:TGS-TB:Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis Using Short-Read Whole-Genome Sequencing. PLoS ONE 10:e0142951, 2015

8)WHO:The use of next-generation sequencing technologies for the detection of mutations associated with drug resistance in Mycobacterium tuberculosis complex:technical guide.　https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/274443/WHO-CDS-TB-2018.19-eng.pdf