公衆衛生87巻5号

2023年05月発行

特集 これからの結核対策—ポストCOVID-19における結核低まん延下の結核対策を考える

全ゲノム解析時代を迎えた結核分子疫学の潮流

著者： 岩本朋忠¹

所属機関： ¹神戸市健康科学研究所

ページ範囲：P.434 - P.440

ポイント
◆ゲノムの変異は次世代、次々世代に受け継がれて蓄積するため、変異の入り方から感染伝播の方向性を推察できる。
◆ゲノム解析は反復配列多型解析法に比べて感染源や感染伝播を追跡する精度が圧倒的に高く、今後の結核分子疫学の基盤技術になる。
◆結核菌ゲノム情報、臨床情報、実地疫学情報を統合して包括的に結果の解釈を行うための標準化された手法が求められる。

参考文献

1）Meehan CJ, et al: Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis: current standards and open issues. Nat Rev Microbiol 17: 533-545, 2019

2）厚生労働省：結核に関する特定感染症予防指針の一部改正について．平成28年11月25日 https://www.mhlw.go.jp/file/06-Seisakujouhou-10900000-Kenkoukyoku/thuuchi.pdf（2023年2月21日閲覧）

3）Walker TM, et al: Whole-genome sequencing to delineate Mycobacterium tuberculosis outbreaks: a retrospective observational study. Lancet Infect Dis 13: 137-146, 2013

4）Winglee K, et al: Logically Inferred Tuberculosis Transmission（LITT）: A Data Integration Algorithm to Rank Potential Source Cases. Front Public Health 9: 667337, 2021

5）CDC gov: TB_molecular_epidemiology.　https://github.com/CDCgov/TB_molecular_epidemiology（2022年12月1日閲覧）

6）CDC gov: Microbe Trace.　https://microbetrace.cdc.gov/MicrobeTrace/（2022年12月1日閲覧）

7）Sekizuka T, et al: TGS-TB: Total Genotyping Solution for Mycobacterium tuberculosis Using Short-Read Whole-Genome Sequencing. PLoS One 10: e0142951, 2015