生体の科学52巻5号

2001年10月発行

特集 モチーフ・ドメインリスト 2．遺伝子発現 転写および関連事象

Relホモロジードメイン

著者： 多留偉功¹ 馳桃子¹ 鈴木利治²

所属機関： ¹東京大学大学院薬学系研究科神経生物物理学教室 ²北海道大学大学院薬学研究科ゲノム機能学講座神経科学分野

ページ範囲：P.386 - P.387

　［アミノ酸配列］
　Relホモロジードメイン（RHD）は約300アミノ酸からなるドメインである。RHD全体でみるとアミノ酸配列上であまり高い相同性はみられない。例えばNF-κBのRHDとNF-ATのRHDとの間では20％程度である^1）。
　ここにRHDのコンセンサス配列としてデータベースPfamのCD-Browser（Web site：www.ncbi.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=pfamOO554）に示されている，GPYLEITEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGESSTKGTKTFPTIEICNYDGPAKIVVSLVTKDEPHRPHPHSLVGKDCKDGICEVELGPEDMVLSFQNLGIQCVKKKEVEEALEERIQRNIDPFNAGQEAKHQIKEMDLNVVRLCFQAFLPDQHGNFTRPLPPVVSDPIYDK（“pfam 00554”）を一応のコンセンサス配列としてあげておく。