生体の科学68巻2号

2017年04月発行

実験講座

1細胞トランスクリプトーム解析の高出力化と自動化

著者： 團野宏樹¹ 二階堂愛¹

所属機関： ¹理化学研究所情報基盤センターバイオインフォマティクス研究開発ユニット

ページ範囲：P.178 - P.184

文献概要

　1細胞トランスクリプトーム解析は，生体を構成する細胞集団に属する細胞の全遺伝子発現量を1細胞ごとに定量する技術である。1細胞トランスクリプトーム解析を行うことで，細胞集団の遺伝子発現量を，平均でなく分布として捉えることや，集団内の希少な亜集団の発見，細胞種比率の同定なども可能である。本稿では，この技術の高出力化と自動化の最前線を解説する。加えて，これらデータ解析の自動化について，仮想計算機技術を用いた新しい試みを紹介する。

参考文献

. 34：e42, 2006

. 6：377-382, 2009

. 14：R31, 2013

. 30：777-782, 2012

. 21：1160-1167, 2011

. 2：666-673, 2012

7）Folch A：Introduction to BioMEMS. CRC Press, Boca Raton, 2012

. 288：113-116, 2000

. 298：580-584, 2002

. 86：4163-4166, 2001

. 16：347-351, 2000

. 12：2572-2597, 2011

. 161：1202-1214, 2015

. 161：1187-1201, 2015