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腸管系感染症のうち，Shigella属菌による疾患は近年減少しているが，一方Salmonella typhi，Salmonella Paratyphi AおよびB，Salmonella sendaiを除くSalmonella属菌による食中毒型腸管感染が増加しつつある（保菌率は約0.6％）．患者からShigella属菌を分離同定するに当たって注意しなければならないことは，Shigella属菌は大腸菌その他と共通抗原をもっている．特に病原大腸菌などは，生物学的性状のうち，TSI培地18〜24時間培養では，乳糖非分解性でガスを産生せず，赤痢菌の因子血清に凝集するので，誤って赤痢菌と判定されやすい．また，分離に当たってはいうまでもなく，SSカンテン培地は選択性が強くて分離率が悪いので，DHL培地などの選択性の弱い培地の併用が望ましい．
S. typhiについて，院内感染を予防する目的で入院予定者の保菌者検索を約1年間行ったところ，数例の保菌者を検出したことがある．特に胆石症の患者などは，ぜひ入院前に検査した後入院させることが必要である．また，新生児のサルモネラ感染の防止対策として，妊産婦の入院前検便は必須である．
