臨床検査49巻7号

2005年07月発行

今月の主題 アレルギー疾患の現況と今後の展望 話題

アレルギー疾患のトランスクリプトーム解析Ⅰ

著者： 斎藤博久¹

所属機関： ¹国立成育医療センター研究所免疫アレルギー研究部

ページ範囲：P.765 - P.768

1. はじめに

　周知のように個体(＝細胞)がもつすべての遺伝情報の意味であるゲノム(genome)は遺伝子(gene)と染色体(chromosome)を合成した用語である．一方，トランスクリプトーム(transcriptome)という用語は，1つの細胞に存在するすべてのmRNA(transcript)情報のことを指す(図1)．ヒトゲノム配列のほぼ全容が明らかになり，一度に数万のmRNAを定量できる装置であるマイクロアレイが開発された前世紀末から登場した新用語である．当初は解析手法であるDifferential display PCRやマイクロアレイの技術が未発達なこともあり，プロテオーム(proteome)という用語のほうがより知られていたが，ここ数年のマイクロアレイ技術の技術的進歩はめざましく，今や多くの研究施設において，PCR法やフローサイトメーターなどと同様に日常研究レベルで全遺伝子のmRNAへの発現状態を定量することが行われるようになっている¹⁾．

　本稿においてはアレルギー疾患病態解析のトランスクリプトーム解析の現況について筆者らの研究を中心に紹介させていただくことにする．

参考文献

１) Saito H, Matsumoto K：Microarray as a standard laboratory technique. Allergology Int 2005 (in press)

２) Saito H, Abe J, Matsumoto K：Allergy-related genes in “micro” array. J Allergy Clin Immunol 2005 (in press)

３) Seki Y, Inoue H, Nagata N, et al：Suppressor of cytokine signaling-3 (SOCS3) regulates onset and maintenance of type 2 helper T cell mediated allergic responses. Nat Med　9：1047-1054, 2003

４) Heishi M, Kagaya S, Katsunuma T, et al：High-density oligonucleotide array analysis of mRNA transcripts in severe atopic dermatitis patients’ peripheral blood cells. Int Arch Allergy Immunol　129：57-66, 2002

５) Nagata N, Oshida T, Yoshida NL, et al：Analysis of highly expressed genes in monocytes from atopic dermatitis patients. Int Arch Allergy Immunol　132：156-167, 2003

６) Zimmermann N, King NE, Laporte J, et al：Dissection of experimental asthma with DNA microarray analysis identifies arginase in asthma pathogenesis. J Clin Invest　111：1863-1874, 2003

７) Kitano H：Systems biology；a brief overview. Science　295：1662-1664, 2002

８) Takeda K, Kaisho T, Akira S：Toll-like receptors. Annu Rev Immunol　21：335-376, 2003

９) Kato A, Ogasawara T, Homma T, et al：lipopolysaccharide-binding protein critically regulates lipopolysaccharide-induced IFN-alpha/beta signaling pathway in human monocytes. J Immunol　172：6185-6194, 2004

10) Hopkins AL, Groom CR：The druggable genome. Nat Rev Drug Discov　1：727-730, 2002

11) Nakajima T, Iikura M, Okayama Y, et al：Identification of granulocyte subtype-selective receptors and ion channels by using a high-density oligonucleotide probe array. J Allergy Clin Immunol　113：528-535, 2004

12) Trontell A：Expecting the unexpected-drug safety, pharmacovigilance, and the prepared mind. N Engl J Med　351：1385-1387, 2004