臨床検査49巻9号

2005年09月発行

今月の主題 キャピラリー電気泳動法 話題

CE-MSを用いたメタボローム解析

著者： 西岡孝明¹² 曽我朋義³

所属機関： ¹京都大学大学院農学研究科応用生命科学専攻生物機能制御化学研究室 ²慶應義塾大学先端生命科学研究所 ³慶應義塾大学先端生命科学研究所・環境情報学部

ページ範囲：P.1015 - P.1020

1．はじめに

　mRNAや蛋白質の網羅的解析によって多量のデータが得られるにもかかわらず，それらが複雑なクラスターやネットワークで互いに関係づけられているので，ごく一部のデータしか利用されていない．多くのデータはその生物学的意味を解釈できずに放置されている．この解釈がバイオインフォマティクスの課題といえる．

　この課題に対して，メタボロームが1つの解決策を与えることがわかってきた．すなわち，メタボロームのデータの上にトランスクリプトームやプロテオームのデータを重ね合わせると，これまで不明瞭であった後者2つの生物学的意味がわかりだしてきたのである¹⁾．すなわち，メタボロームはゲノム情報が環境と相互作用するシステムである，ことが認識されつつある．したがって，メタボロームの化学分析は，ゲノム科学をはじめ科学や医療，創薬，生物工学の分野で必要不可欠な技術となっている．

　本章では，われわれが実用化に成功したCE-MSを用いた水溶性代謝物質のメタボローム化学分析法について技術解説を行う．

参考文献

１) Nishioka T, Matsuda K, Fujita Y：Combined analysis of metabolome and transcriptome；catabolism in Bacillus subtilis, Metabolomics. The Frontier of Systems Biology (Tomita T, Nishioka T, eds). Springer-Verlag, Tokyo, pp 127-140, 2005

２) Wagner C, Sefkow M, Kopka J：Construction and application of a mass spectral and retention time index database generated from plant GC/EI-TOF-MS metabolite profiles. Phytochemistry　62：887-900, 2003

３) Soga T：Development and application of capillary electrophoresis-mass spectrometry methods to metabolomics. Metabolomics. The Frontier of Systems Biology (Tomita T, Nishioka T, eds). Springer-Verlag, Tokyo, pp 7-24, 2005

４) Maharjan R, Ferenci T：Global metabolite analysis：the influence of extraction methodology on metabolome profiles of Escherichia coli. Anal Biochem　313：145-154, 2003

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７) Soga T, Ueno Y, Naraoka H, et al：Simultaneous determination of anionic intermediates for Bacillus subtilis metabolic pathways by capillary electrophoresis electrospray ionization mass spectrometry. Anal Chem　74：2233-2239, 2002

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