臨床検査51巻12号

2007年11月発行

特集 遺伝子検査―診断とリスクファクター 2．解析技術 B．検査技術 c．染色体・ゲノムレベル

4) 網羅的解析法：プロテオーム

著者： 曽川一幸¹ 朝長毅¹² 野村文夫¹²³

所属機関： ¹千葉大学医学部附属病院疾患プロテオミクス研究センター ²千葉大学大学院医学研究院分子病態解析学 ³千葉大学医学部付属病院検査部

ページ範囲：P.1340 - P.1346

はじめに

　ポストゲノムあるいはポストシークエンス時代に入り，トランスクリプトーム，さらにはプロテオームが盛んに論じられるようになった．DNAマイクロアレイなどによるmRNAの網羅的発現解析が現在盛んに行われているが，①細胞内でのmRNA発現量と蛋白質産生量とは必ずしも比例しないこと，②蛋白質の活性は細胞内での局在やプロセシング，翻訳後修飾などmRNAとは別のレベルでされていることなどから，プロテオーム解析は重要であり，その解析技術の進歩とあいまって，近年急速な展開をみせている．全発現蛋白質を対象とする網羅的プロファイリングに加えて，特定の病態に関する蛋白質をターゲットとする疾患プロテオミクス，創薬プロテオミクスは臨床に深くかかわってくる．

　本稿では，臨床検査からみた疾患プロテオミクスについて自験例を含めて述べる．

参考文献

1) 平野久：プロテオミクスの概念とプロテオーム解析．臨床検査　47：1209-1214, 2003

2) Tirumalai RS, Chan KC, Prieto DA, et al：Characterization of the low molecular weight human serum proteome. Mol Cell Proteomics　10：1096-1103, 2003

3) Shen Y, Kim J, Strittmatter EF, et al：Characterization of the human blood plasma proteome. Proteomics　5：4034-4045, 2005

4) Hortin GL：The MALDI-TOF mass spectrometric view of the plasma proteome and peptidome. Clin Chem　52：1223-1237, 2006

5) Villanueva J, Shaffer DR, Philip J, et al：Differential exoprotease activities confer tumor-specific serum peptidome patterns. J Clin Invest　116：271-284, 2006

6) Pieper R, Su Q, Gastlin CL, et al：Multiconponent immunoaffinity subtraction chromatography：an innovative step towards a comprehensive survey of the human plasma proteome. Proteomics　3：422-432, 2003

7) Bjorhall K, Miliotis T, Davidsson P：Comparison of different depletion strategies for improved resolution in proteomic analysis of human serum samples. Proteomics　5：307-317, 2005

8) Lowenthal MS, Mehta AI, Frogale K, et al：Analysis of albumin-associated peptides and protein from ovarian cancer patients. Clin Chem　51：1933-1945, 2005

9) Wasinger VC, Cordwell SJ, Cerpa-poljak A, et al：Progress with gene-product mapping of the Mollicutes：Mycoplasma genitalium. Electrophoresis　16：1090-1094, 1995

10) Nomura F, Tomonaga T, Sogawa K, et al：Identification of novel and downregulated biomarkers for alcoholism by surface enhanced laser desorption/ionization-mass spectrometry. Proteomics 4：1187-1194, 2004

11) Sogawa K, Tomonaga T, Nomura F, et al：Diagnostic Values of SELDI-TOF MS technology for screening of habitual drinkers. Alcoolism Clim Exp Res　31：22S-26S, 2007

12) O'Farrell PH：High resolution two-dimensional electrophoresis of serum protein. Nature　177：1033, 1956

13) Bjellqvist B, Righetti PG, Gianazza E, et al：Isoelectric focusing in immobilized pH gradients：principle, methodology and some applications. J Biochem Biophys Methods　6：317-339, 1982

14) Oh-Ishi M, Satoh M, Maeda T：Preparative two-dimensional gel electrophoresis with agarose gels in the first dimension for high molecular mass proteins. Electrophoresis　21：1653-1669, 2000

15) Tomonaga T, Matsushita K, Yamaguchi S, et al：Identification of altered protein expression and post-translational modifications in primary colorectal cancer by using agarose two-dimensional gel electrophoresis. Clin Cancer Res　10：2007-2014, 2004

16) Unlu M, Morgan ME, Minden JS：Difference gel electrophoresis：a single gel method for detecting changes in protein extracts. Electrophoresis　18：2071-2077, 1997

17) Nishimori T, Tomonaga T, Matsushita K, et al：Proteomics analysis of primary esophageal squamous cell carcinoma reveals downregulation of a cell adhesion protein, periplakin. Proteomics　6：1011-1018, 2006