臨床検査55巻11号

2011年10月発行

特集 ここまでわかった自己免疫疾患 総論

4．疾患感受性遺伝子とは

著者： 高地雄太¹

所属機関： ¹理化学研究所ゲノム医科学研究センター自己免疫疾患研究チーム

ページ範囲：P.1074 - P.1080

一部の単一遺伝子疾患を除いて，自己免疫疾患の多くは，複数の遺伝因子と環境因子によって発症する多因子疾患である．ここ数年で行われたゲノムワイド関連解析によって，多くのありふれた遺伝子多型(common variant)が疾患発症にかかわっていることが明らかになった．これらの多くは複数の自己免疫疾患によって共有される疾患感受性遺伝子であるが，一部には疾患特異的な感受性遺伝子も存在する．すなわち，これらの疾患感受性遺伝子の組み合わせによって，個人における疾患の発症リスクが規定されているものと考えられる．さらに，次世代シークエンサーの登場により，個人の全ゲノム配列の解読が可能となり，疾患にかかわる稀な変異(rare variant)についても，その探索が始まろうとしている．

参考文献

1) Rai E, Wakeland EK : Genetic predisposition to autoimmunity―what have we learned? Semin Immunol　23：67-83，2011

2) Sakaguchi N, Takahashi T, Hata H, et al : Altered thymic T-cell selection due to a mutation of the ZAP-70 gene causes autoimmune arthritis in mice. Nature　426：454-460，2003

3) Frazer KA, Ballinger DG, Cox DR, et al : A second generation human haplotype map of over 3.1 million SNPs. Nature　449：851-861，2007

4) Stahl EA, Raychaudhuri S, Remmers EF, et al : Genome-wide association study meta-analysis identifies seven new rheumatoid arthritis risk loci. Nat Genet　42：508-514，2010

5) Bottini N, Musumeci L, Alonso A, et al : A functional variant of lymphoid tyrosine phosphatase is associated with type I diabetes. Nat Genet　36：337-338，2004

6) Gregersen PK, Lee HS, Batliwalla F, et al : PTPN22 : setting thresholds for autoimmunity. Semin Immunol　18：214-223，2006

7) Plenge RM, Cotsapas C, Davies L, et al : Two independent alleles at 6q23 associated with risk of rheumatoid arthritis. Nat Genet　39：1477-1482，2007

8) Musone SL, Taylor KE, Lu TT, et al : Multiple polymorphisms in the TNFAIP3 region are independently associated with systemic lupus erythematosus. Nat Genet　40：1062-1064，2008

9) Remmers EF, Plenge RM, Lee AT, et al : STAT4 and the risk of rheumatoid arthritis and systemic lupus erythematosus. N Engl J Med　357：977-986，2007

10) Wellcome Trust Case Control Consortium : Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature　447：661-678，2007

11) Graham RR, Kozyrev SV, Baechler EC, et al : A common haplotype of interferon regulatory factor 5 (IRF5) regulates splicing and expression and is associated with increased risk of systemic lupus erythematosus. Nat Genet　38：550-555，2006

12) Kochi Y, Okada Y, Suzuki A, et al : A regulatory variant in CCR6 is associated with rheumatoid arthritis susceptibility. Nat Genet　42：515-519，2010

13) Lee-Kirsch MA, Gong M, Chowdhury D, et al : Mutations in the gene encoding the 3′-5′ DNA exonuclease TREX1 are associated with systemic lupus erythematosus. Nat Genet　39：1065-1067，2007

14) Surolia I, Pirnie SP, Chellappa V, et al : Functionally defective germline variants of sialic acid acetylesterase in autoimmunity. Nature　466：243-247，2010

15) Altshuler D, Durbin RM, Abecasis GR, et al : A map of human genome variation from population-scale sequencing. Nature　467：1061-1073，2010