臨床検査57巻4号

2013年04月発行

今月の特集1 次世代の微生物検査

次世代シークエンサーを用いたヒト常在菌叢の大量16S解析

著者： 服部正平¹ 金相完² 須田亙¹

所属機関： ¹東京大学大学院新領域創成科学研究科 ²東京大学大学院農学生命科学研究科

ページ範囲：P.406 - P.414

■次世代シークエンサーの登場は，大量データをベースにした複雑な細菌叢の菌種や遺伝子の，培養に依存しない網羅的解析を可能にした．

■従来よりも高い定量性を付与した網羅的16SリボソームRNA遺伝子シークエンシングによるヒト腸内（常在）細菌叢の解析法を開発した．

■大量の16SデータのOTUとUniFrac distance解析を用いて細菌叢間の相違や細菌叢に特徴的な菌種をピンポイントで同定する方法を開発した．

■培養した細菌種の個別ゲノム解析は，16Sおよびメタゲノムデータの有効活用に必要である．

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