臨床検査65巻11号

2021年11月発行

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今月の特集1 今さら？ 今だから学ぶPCR

薬剤耐性菌のPCR検査

著者： 石井良和¹

所属機関： ¹東邦大学医学部微生物・感染症学講座

ページ範囲：P.1164 - P.1168

Point

●耐性菌をPCR検査で検出することは現実的でない．耐性菌は薬剤感受性検査で検出し，その耐性因子の責任遺伝子を明らかにする際にPCRを使用すべきである．

●耐性に関与する責任遺伝子のアミノ酸置換変異の型別をPCRで行うことは困難である．このような変異を検出する場合は，DNAシークエンスとの併用が必要となる．

●検出頻度が低い耐性因子や臨床上問題となる耐性因子などの責任遺伝子の検出は，院内感染の兆候の早期把握に有益な疫学マーカーとなる場合がある．

●耐性菌の耐性因子検出のためのPCR用の試薬やキットには体外診断用医薬品（IVD）が存在しないため，自施設で採用している検出法の妥当性評価・検証と精度管理が必要である．

参考文献

1）Van der Bij AK, Van Mansfeld R, Peirano G, et al：First outbreak of VIM-2 metallo-β-lactamase-producing Pseudomonas aeruginosa in The Netherlands: microbiology, epidemiology and clinical outcomes. Int J Antimicrob Agents　37：513-518，2011

2）Power EG：RAPD typing in microbiology--a technical review. J Hosp Infect　34：247-265，1996

3）McClelland M, Welsh J：DNA fingerprinting by arbitrarily primed PCR. PCR Methods Appl　4：S59-S65，1994

4）Suzuki M, Yamada K, Aoki M, et al：Applying a PCR-based open-reading frame typing method for easy genotyping and molecular epidemiological analysis of Pseudomonas aeruginosa. J Appl Microbiol　120：487-497，2016

5）Anjum MF, Zankari E, Hasman H：Molecular Methods for Detection of Antimicrobial Resistance. Microbiol Spectr　5，2017

6）Dallenne C, Da Costa A, Decré D, et al：Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important beta-lactamases in Enterobacteriaceae. J Antimicrob Chemother　65：490-495，2010

7）Tracz DM, Boyd DA, Bryden L, et al：Increase in ampC promoter strength due to mutations and deletion of the attenuator in a clinical isolate of cefoxitin-resistant Escherichia coli as determined by RT-PCR. J Antimicrob Chemother　55：768-772，2005

8）Pérez-Pérez FJ, Hanson ND：Detection of plasmid-mediated AmpC beta-lactamase genes in clinical isolates by using multiplex PCR. J Clin Microbiol　40：2153-2162，2002

9）Geyer CN, Reisbig MD, Hanson ND：Development of a TaqMan multiplex PCR assay for detection of plasmid-mediated ampC β-lactamase genes. J Clin Microbiol　50：3722-3725，2012

10）Geyer CN, Hanson ND：Multiplex high-resolution melting analysis as a diagnostic tool for detection of plasmid-mediated AmpC β-lactamase genes. J Clin Microbiol　52：1262-1265，2014

genes by multiplex PCR assay. J Med Microbiol　54（Pt 12）：1183-1187，2005

12）Shanmugakani RK, Akeda Y, Yamamoto N, et al：PCR-Dipstick Chromatography for Differential Detection of Carbapenemase Genes Directly in Stool Specimens. Antimicrob Agents Chemother　61：e00067-17，2017

13）Taniguchi Y, Koide S, Maeyama Y, et al：Predominance of methicillin-resistant Staphylococcus aureus SCCmec type II-CC5 and SCCmec type IV-CC1/CC8 among companion animal clinical isolates in Japan: Findings from phylogenetic comparison with human clinical isolates. J Glob Antimicrob Resist　20：253-259，2020

14）Hoorfar J, Malorny B, Abdulmawjood A, et al：Practical considerations in design of internal amplification controls for diagnostic PCR assays. J Clin Microbiol　42：1863-1868，2004