臨床検査65巻11号

2021年11月発行

今月の特集1 今さら？ 今だから学ぶPCR

がんのリキッドバイオプシーにおけるPCRの役割

著者： 加藤菊也¹

所属機関： ¹奈良先端科学技術大学院大学先端科学技術研究科

ページ範囲：P.1178 - P.1183

Point

●血液中には細胞死の結果，放出された遊離DNAが存在する．遊離DNAは約170塩基対に分解されており，がん患者では腫瘍由来のDNA（血中腫瘍DNA）が混在している．

●血中腫瘍DNAを用いてがん細胞の遺伝子異常を検出するリキッドバイオプシーでは，感度の高いPCR技術が必要である．

●リキッドバイオプシーでは，リアルタイムPCRよりも感度の高いデジタルPCRが用いられる．現在では，デジタルPCRで鋳型調製を行う次世代シークエンサーが標準検出技術である．

●リキッドバイオプシーはコンパニオン診断とゲノムプロファイリングで実用化されている．

参考文献

1）Diehl F, Schmidt K, Choti MA, et al：Circulating mutant DNA to assess tumor dynamics. Nat Med　14：985-990，2008

2）Lo YM, Zhang J, Leung TN, et al：Rapid clearance of fetal DNA from maternal plasma. Am J Hum Genet　64：218-224，1999

3）Diehl F, Li M, Dressman D, et al：Detection and quantification of mutations in the plasma of patients with colorectal tumors. Proc Natl Acad Sci U S A　102：16368-16373，2005

4）Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ, et al：Detection of circulating tumor DNA in early- and late-stage human malignancies. Sci Transl Med　6：224ra24，2014

5）Kato K, Uchida J, Kukita Y, et al：Transient appearance of circulating tumor DNA associated with de novo treatment. Sci Rep　6：38639，2016

6）Abbosh C, Birkbak NJ, Wilson GA, et al：Phylogenetic ctDNA analysis depicts early-stage lung cancer evolution. Nature　545：446-451，2017

7）Vogelstein B, Kinzler KW：Digital PCR. Proc Natl Acad Sci U S A　96：9236-9241，1999

8）加藤菊也：精密医療電脳書　血中腫瘍DNAのPCR増幅：デジタルPCRの応用，2021（https://precision-medicine.jp/entry/digital-pcr）（最終アクセス：2021年5月14日）

9）Brenner S, Johnson M, Bridgham J, et al：Gene expression analysis by massively parallel signature sequencing (MPSS) on microbead arrays. Nat Biotechnol　18：630-634，2000

10）Kukita Y, Uchida J, Oba S, et al：Quantitative identification of mutant alleles derived from lung cancer in plasma cell-free DNA via anomaly detection using deep sequencing data. PLoS One　8：e81468，2013

11）Uchida J, Kato K, Kukita Y, et al：Diagnostic Accuracy of Noninvasive Genotyping of EGFR in Lung Cancer Patients by Deep Sequencing of Plasma Cell-Free DNA. Clin Chem　61：1191-1196，2015

12）Steensma DP, Bejar R, Jaiswal S, et al：Clonal hematopoiesis of indeterminate potential and its distinction from myelodysplastic syndromes. Blood　126：9-16，2015

13）Liu MC, Oxnard GR, Klein EA, et al：Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. Ann Oncol　31：745-759，2020