臨床検査66巻11号

2022年11月発行

今月の特集 マイクロバイオーム

Microbiomeと感染症

著者： 嶋崎鉄兵¹

所属機関： ¹杏林大学医学部感染症科

ページ範囲：P.1290 - P.1295

Point

●感染症診療とマイクロバイオームの世界は，似て非なるものである．

●16S rRNA菌叢解析のみでマイクロバイオームの全てを理解できるわけではない．

●マイクロバイオームを治療対象とした試みの現状を理解する．

●マイクロバイオームの評価がなぜ難しいかを理解する．

●マイクロバイオームが感染管理の未来にどうつながるかを理解する．

参考文献

1）Morency-Potvin P, Schwartz DN, Weinstein RA：Antimicrobial Stewardship: How the Microbiology Laboratory Can Right the Ship. Clin Microbiol Rev　30：381-407，2016

2）Koch R：Die ätiologie der milzbrand-krankheit, begründet auf die entwicklungsgeschichte des bacillus anthracis. Robert Koch-Institut, 2010（http://dx.doi.org/10.25646/5064）（最終アクセス：2022年7月28日）

3）Young VB：The role of the microbiome in human health and disease: an introduction for clinicians. BMJ　356：j831，2017

4）Eiseman B, Silen W, Bascom GS, et al：Fecal enema as an adjunct in the treatment of pseudomembranous enterocolitis. Surgery　44：854-859，1958

5）Johnson S, Lavergne V, Skinner AM, et al：Clinical Practice Guideline by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and Society for Healthcare Epidemiology of America (SHEA): 2021 Focused Update Guidelines on Management of Clostridioides difficile Infection in Adults. Clin Infect Dis　73：e1029-e1044，2021

6）Chang JY, Antonopoulos DA, Kalra A, et al：Decreased diversity of the fecal Microbiome in recurrent Clostridium difficile-associated diarrhea. J Infect Dis　197：435-438，2008

7）Tuomisto H：A consistent terminology for quantifying species diversity? Yes, it does exist．Oecologia　164：853-860，2010

8）Blount K, Jones C, Walsh D, et al：Development and Validation of a Novel Microbiome-Based Biomarker of Post-antibiotic Dysbiosis and Subsequent Restoration. Front Microbiol　12：781275，2022

9）Feuerstadt P, Louie TJ, Lashner B, et al：SER-109, an Oral Microbiome Therapy for Recurrent Clostridioides difficile Infection. N Engl J Med　386：220-229，2022

10）Connelly S, Fanelli B, Hasan NA, et al：SYN-007, an Orally Administered Beta-Lactamase Enzyme, Protects the Gut Microbiome from Oral Amoxicillin/Clavulanate without Adversely Affecting Antibiotic Systemic Absorption in Dogs. Microorganisms　8：152，2020

11）Taur Y, Xavier JB, Lipuma L, et al：Intestinal domination and the risk of bacteremia in patients undergoing allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. Clin Infect Dis　55：905-914，2012

12）Shimasaki T, Seekatz A, Bassis C, et al：Increased Relative Abundance of Klebsiella pneumoniae Carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae Within the Gut Microbiota Is Associated With Risk of Bloodstream Infection in Long-term Acute Care Hospital Patients. Clin Infect Dis　68：2053-2059，2019

13）Hayden MK, Lin MY, Lolans K, et al：Prevention of colonization and infection by Klebsiella pneumoniae carbapenemase-producing enterobacteriaceae in long-term acute-care hospitals. Clin Infect Dis　60：1153-1161，2015

14）Shimasaki T, Rhee Y, Yelin RD, et al：1764. the gut: A veiled reservoir for multidrug-resistant organisms (MDROs) below the tip of the iceberg. Open Forum Infect Dis　5：S63，2018（https://doi.org/10.1093/ofid/ofy209.149）（最終アクセス：2022年7月28日）

15）León C, Ruiz-Santana S, Saavedra P, et al：A bedside scoring system (“Candida score”) for early antifungal treatment in nonneutropenic critically ill patients with Candida colonization. Crit Care Med　34：730-737，2006