臨床整形外科57巻3号

2022年03月発行

特集 診断・治療に難渋したPeriprosthetic Joint Infectionへの対応 診断編

—細菌培養陰性例への対応—Next-generation Sequencingの現状と可能性

著者： 植田成実¹² 飯田寛和³ 齋藤貴徳⁴

所属機関： ¹関西医科大学総合医療センター整形外科 ²関西医科大学総合医療センターゲノム解析センター ³関西医科大学リハビリテーション学部 ⁴関西医科大学附属病院整形外科

ページ範囲：P.233 - P.240

Next-generation sequencing(NGS)の出現は，医学・生物学に革新的なインパクトをもたらした．NGSは，ゲノム解析を短時間かつ安価で行うことを可能とし，Musculoskeletal Infection Societyによる人工関節周囲感染の診断ガイドラインでは，診断未確定の症例にNGSを考慮することが注訳として記載されている．これまで培養検査ではviable but nonculturable (VBNC) state bacteriaを検出することができなかったが，培養困難な複数細菌もNGSは1〜2日で網羅的に検出できる．しかし，NGSは相対的検査であることに注意を要し，検体に含まれる原因菌が少ない場合に精度が落ち，偽陽性を生じ得る．培養陰性の場合，抜去されたインプラント超音波処理液を含む複数検体に対し定量PCR(qPCR)などの遺伝子定量検査を行い，含まれる細菌遺伝子量の多い検体に対しNGSを行う必要がある．そして，NGS結果に対し，陽性・陰性コントロールを用いた詳細な分析を行い，さまざまなコンタミネーションに配慮し，病態に関わる細菌を特定することで診断未確定の症例にNGSを用いた原因菌の同定と診断が可能となる．

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