臨床検査55巻9号

2011年09月発行

今月の主題 RNAの解析 各論 〈RNA解析の新技術〉

タイリングアレイによるmRNA解析

著者： 甲斐田大輔¹

所属機関： ¹富山大学先端ライフサイエンス研究拠点

ページ範囲：P.854 - P.857

最近の研究から，遺伝子内の部分的な変化が，癌や神経変性疾患などの病気を引き起こすことが明らかとなってきた．したがって，そのようなわずかな変化をとらえることが，疾患の診断やオーダーメイド治療などに役立つと考えられる．従来の技術では，短い領域を対象にしたゲノムワイドな解析は行うことができなかったが，タイリングアレイという新しい技術を用いることによって，遺伝子内の部分的な変化を，多くの遺伝子において同時に観察できるようになった．そこで本稿では，タイリングアレイの概説とその応用性に関して述べたいと思う．

参考文献

1) 前田明，大江賢治：RNAのプロセッシング．RNAがわかる(中村義一編)，羊土社，pp39-48，2003

2) Cooper TA, Wan L, Dreyfuss G : RNA and disease. Cell　136：777-793，2009

3) Mockler TC, Chan S, Sundaresan A, et al : Applications of DNA tiling arrays for whole-genome analysis. Genomics　85：1-15，2005

4) Keren H, Lev-Maor G, Ast G. Alternative splicing and evolution : diversification, exon definition and function. Nat Rev Genet　11：345-355，2010

5) Wang ET, Sandberg R, Luo S, et al : Alternative isoform regulation in human tissue transcriptomes. Nature　456：470-476，2008

6) Kaida D, Berg MG, Younis I, et al : U1 snRNP protects pre-mRNAs from premature cleavage and polyadenylation. Nature　468：664-668，2010

7) Kaida D, Motoyoshi H, Tashiro E, et al : Spliceostatin A targets SF3b and inhibits both splicing and nuclear retention of pre-mRNA. Nat Chem Biol　3：576-583，2007

8) Folkers ME, Delker DA, Maxwell CI, et al : ENCODE tiling array analysis identifies differentially expressed annotated and novel 5' capped RNAs in hepatitis C infected liver. PLoS One　6：e14697，2011