臨床検査67巻9号

2023年09月発行

今月の特集 COVID-19と臨床検査—得られた知見を今後の医療に活かす

変異株スクリーニング検査法

著者： 東田修二¹

所属機関： ¹東京医科歯科大学病院検査部

ページ範囲：P.954 - P.958

Point

●新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の変異株の大まかな同定は，次世代シークエンサ（NGS）を用いなくてもPCRの解離曲線分析によって可能である．

●東京では武漢株，欧州株，R.1株，アルファ株，デルタ株，オミクロン株（BA.1，BA.2，BA.5，およびその派生株）と，次々に変異株が入れ替わった．

●変異株の型情報に基づく患者管理や薬の選択は診療に有用であったが，検査コストの問題がある．

参考文献

1）Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, et al：Tracking Changes in SARS-CoV-2 Spike: Evidence that D614G Increases Infectivity of the COVID-19 Virus. Cell　182：812-827，2020

2）東田修二：変異株同定の実際とあり方．日臨検医会誌　70：211-213，2022

3）日本臨床検査標準協議会遺伝子関連検査標準化専門委員会（編）：新型コロナウイルス核酸増幅検査の精度管理ガイダンス，学術広告社，2021

4）Nagano K, Tani-Sassa C, Iwasaki Y, et al：SARS-CoV-2 R.1 lineage variants that prevailed in Tokyo in March 2021. J Med Virol　93：6833-6836，2021

5）Tani-Sassa C, Iwasaki Y, Ichimura N, et al：Viral loads and profile of the patients infected with SARS-CoV-2 Delta, Alpha, or R.1 variants in Tokyo. J Med Virol　94：1707-1710，2022

6）Yuasa S, Nakajima J, Takatsuki Y, et al：Viral load of SARS-CoV-2 Omicron is not high despite its high infectivity. J Med Virol　94：5543-5546，2022

7）Takatsuki Y, Takahashi Y, Nakajima J, et al：Viral load of SARS-CoV-2 Omicron BA.5 is lower than that of BA.2 despite the higher infectivity of BA.5. Immun Inflamm Dis　11：e783，2023